يختص قسم العقاقير والنواتج الطبيعية بدراسة الأصول النباتية للعقاقير الطبية بشكلها الخام وبخواصها الظاهرية والمجهرية , كما يهتم بدراسة المكونات الكيميائية الفعالة وتأثيرها على جسم الإنسان وطرق استخلاصها من أصولها الطبيعية وكيفية الكشف عنها.
ومعا صعوبة الحصول والتعرف على اغلب النبات التي يتم دراستها في مشاريع التخرج للاطلاب من هنا جاء أهمية  انشاء حديقة الأعشاب والنبات الطبية في كلية الصيدلة بمساحة تصل الى 25*95 متر والتي ستكون بمثابة البيئة الطبيعية لطلاب الكلية لتمكينهم من دراسة الأعشاب والنباتات الطبية  خصوصاً أن اليمن تحتوي على تنوع فريد في هذه الأعشاب الطبية أكدتها العديد من الدراسات أن ازدهار طب الأعشاب في اليمن يعود إلى تنوع وغزارة الغطاء النباتي حيث يوجد في اليابسة فقط أكثر من 3 آلاف نوع من النباتات فيما يبلغ عدد النباتات المتوطنة التي لا يوجد مثيل لها في أي مكان في العالم 415 نوعاً نباتياً منها 236 نوعاً في جزيرة سُقطرى فقط
أو
يؤهل الطالب للتعرف العقاقير أو الأدوية من أصل طبيعي سواء كان نباتية برية أو بحرية أو من مصادر طبيعية أخرى، وكيفية استخراج المواد الأولية الفعالة اللازمة المستخدمة في العقاقير والأدوية وغيرها …

توصيف المقررات بقسم العقاقير والنواتج الطبيعية:-
(1) عقاقير:
يهدف هذا المقرر والذي يدرس لطلاب السنة الأولى لتعريف طلاب كلية الصيدلة بأهمية العقاقير والنباتات الطبية كمصدر مهم للأدوية، حيث يهتم هذا الفرع من العلوم الصيدلانية بدراسة النباتات الطبية من حيث أصلها وتصنيفها وتوزيعها الجغرافي ومكوناتها واستخداماتها الطبية والشعبية.

(2) كيمياء عقاقير:
يهدف هذا المقرر والذي يدرس لطلاب السنة الثانية إلى دراسة المواد الفعالة في النباتات الطبية من خلال معرفة صفاتها الكيميائية والفيزيائية وطرق استخلاصها وكيفية تحديد التركيب الكيميائي للمكونات الفعالة الــتي ترتبط بالتأثير والاستعمال الدوائي لهذه النباتات.

(3) عقاقير تطبيقية:
يهدف هذا المقرر والذي يدرس لطلاب السنة الثالثة إلى دراسة أصول المعالجات بالنباتات الطبية، وذلك من خلال التعريف بأهم المستحضرات الصيدلانية من أصل نباتي والطرق المختلفة لتشكيلها صيدلانيا، كما يهتم بتعريف وتصنيف المستحضرات النباتية حسب مجموعتها العلاجية وطرق معايرتها وضبط الجودة لها.